Naczelny Sąd Administracyjny w wyroku z 15 grudnia 2022 r. sygn. II FSK 1172/20 orzekł, że spółka działająca w grupie kapitałowej ma prawo do odliczenia całej kwoty 10 mln zł przy zapłacie podatku z przychodów z budynków w sytuacji, w której nie ma udziałów w podmiotach, które są właścicielami budynków.
Podatek od przychodów z budynków został określony w art. 24b ustawy o CIT, dotyczy on przychodu z budynku położonego na terytorium Polski, który stanowi własność lub współwłasność podatnika i został oddany w używanie na podstawie umowy najmu, dzierżawy lub innej umowy o podobnym charakterze. Podstawę opodatkowania stanowi wartość początkowa budynków pomniejszona o kwotę 10 mln zł.
Przedmiotowy wyrok NSA dotyczy wspomnianego pomniejszenia oraz ustalenia w jakiś sposób podzielić kwotę 10 mln zł zmniejszającą podstawę opodatkowania, w sytuacji gdy podatnik należy do grupy kapitałowej.
Wnioskodawca, będący spółką z o.o., zajmuje się obrotem nieruchomościami, jak również ich obsługą. Należy do grupy kapitałowej zajmującej się produkcją leków i suplementów diety. Podmiot dominujący posiada 98% udziałów Wnioskodawcy. Ma też udziały przekraczające 25% w innych podmiotach należących do grupy. Wnioskodawca jest właścicielem nieruchomości, które wynajmuje innym podmiotom i z tego tytułu płaci podatek od przychodów z budynków, nie ma natomiast udziałów w jakichkolwiek podmiotach, które byłyby zobowiązane do zapłaty tego podatku.
Wątpliwości w przedmiotowej sprawie dotyczyły proporcjonalnego podziału kwoty 10 mln zł, pomiędzy spółki, których udziałowcem jest Wnioskodawca. Zgodnie z art. 24b ust. 10 ustaw o CIT, w przypadku gdy podatnik posiada co najmniej 25% udziałów w kapitale innego podmiotu powiązanego, to kwotę 10 mln zł ustala się w takiej proporcji, w jakiej przychód z budynków pozostaje do ogólnej kwoty takich przychodów podatnika oraz podmiotów z nim powiązanych.
Spółka była zdania, że w przypadku gdy jej większościowym udziałowcem jest spółka dominująca, ale Wnioskodawca nie ma udziałów w żadnej spółce zobowiązanej do zapłaty podatku z tytułu przychodów z budynków, to wówczas może pomniejszyć podstawę opodatkowania o całą kwotę 10 mln zł, bez obliczania proporcji.
Dyrektor KIS w wydanej interpretacji indywidualnej wyraził odmienne stanowisko, zgodnie z którym proporcja dotyczy wszystkich podmiotów powiązanych, a więc również spółki dominującej, która jest większościowym udziałowcem Wnioskodawcy i bez znaczenia pozostaje fakt, że Wnioskodawca nie posiada udziałów w podmiotach zobowiązanych do płacenia podatku od przychodów z budynków. Dyrektor KIS w uzasadnieniu powoływał się na uzasadnienie do projektu nowelizacji, którą podatek od budynków został wprowadzony, zgodnie z którym przepis miał zapobiegać celowemu kształtowaniu własności budynków przez podmioty powiązane, w taki sposób aby płaciły one niższy podatek.
Z takim podejściem nie zgodził się WSA we Wrocławiu, uchylając zaskarżoną interpretację. Sąd zgodził się ze spółką, powołując się na wykładnię literalną przy interpretacji przepisu, która w jego ocenie nie stoi w sprzeczności z interpretacją celowościową. Przyznał spółce rację wskazując, że przepis ma zastosowanie wyłącznie do podmiotów, w których kapitale spółka ma udziały i bez znaczenia pozostaje fakt, czy inne podmioty posiadają udziały w kapitale podatnika podatku od przychodów z budynków. Spółka ma więc prawo do odliczenia całej kwoty 10 mln zł przy zapłacie podatku z tytułu przychodów z budynków, jeśli ma nie udziałów w podmiotach będących właścicielami budynków.
Powyższa argumentacja została podtrzymana w wyroku NSA z 15 grudnia 2022, sygn. II FSK 1172/20.